Les armoiries de Botrugno ont un fond brun clair et représentent un crabe. Sur la gauche des armoiries, il y a un sarment de vigne et sur la droite une étoile comète. La découverte dans le territoire d'un menhir appelé Montebianco, nous témoigne que l'homme vécut sur ces terres dès la préhistoire. Aujourd’hui, le mégalithe est haut environ 1,60 m mais à l’origine il mesurait différemment. Ces anciens monuments étaient installés dans le terrain ou dans la roche par le peuple indigènes qui les utilisaient probablement pour adorer les dieux. Actuellement, le menhir n’est pas en très bonnes conditions. En ce qui concerne les origines du premier village, nous n’avons pas de documents historiques, mais différentes hypothèses ont été formulées. Certains pensent que dans le centre s’établit une colonie de grecs introduisant la culture de la vigne. Donc le toponyme dérive du terme grec "botrumai" qui signifie justement "cultiver le raisin". Ou bien encore, il pourrait dériver du nom grec du dieu Bacchus, qui selon la mythologie était le dieu du vin et des fruits. Selon une autre hypothèse, le premier village naquit grâce à l'arrivée des rescapés qui échappèrent à la destruction de l’hameau de Muro, qui a eut lieu vers le XIe siècle, sur ordre des soldats de Guillaume le Mauvais. Les pauvres gens probablement furent attirés dans le territoire pour le bon climat et la fertilité du terrain. L'époque féodale commença avec l'arrivée des Normands, lorsque le Roi Tancrède D'Altavilla confia le centre à Lancellotto Capece. Successivement, il fut acheté par les Maremonti qui gouvernèrent jusqu'à la moitié du XVIIe siècle. Vers 1650, Carlo Castriota Scanderberg acheta le fief de Botrugno. Les derniers seigneurs féodaux furent les Guarini qui gardèrent le centre jusqu'en 1806, année de suppression de la féodalité. Jusqu'en 1958, année dans laquelle Botrugno obtint son autonomie administrative, le village était un écart de Nociglia. Parmi les personnages importants du village, il faut signaler Francesco Maria Castriota et Oronzo Bello. Ce dernier vécut entre le XIXe et le XXe siècle, et fut prêtre du village très aimé et estimé. Il était un point de repère pour toute la population et quand la mort le surpris il fut regretté par tous le monde. Francesco Maria Castriota vécut entre le XVIIIe et le XIXe siècle, provenant de la noble famille de feudataire de Botrugno. Attiré de l'art et de la belle vie, il aimait le  jeu de hasard et perdit nombreuses de ses possessions.